RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DSE	Q9UL01	958 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM196B	A6NMK8	535 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KDM1A	O60341	852 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CBX6	O95503	412 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	HOXC9	P31274	260 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADD2	P35612	726 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TFCP2	Q12800	502 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DGKZ	Q13574	1117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDK3	Q15120	406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NPTX1	Q15818	432 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	USP51	Q70EK9	711 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TTC13	Q8NBP0	860 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159		A0A1B0GTW7	788 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159		E7ESA3	106 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	EYA2	O00167	538 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	IL18RAP	O95256	599 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GSS	P48637	474 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NR5A1	Q13285	461 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAPK6	Q16659	721 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DUSP7	Q16829	419 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	VMP1	Q96GC9	406 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ALPK3	Q96L96	1907 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159		A0A0G2JMP0	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159		H0Y858	1186 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159		H3BNH8	94 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159		K7EPI3	171 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC22	O60826	627 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GABBR2	O75899	941 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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