RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 PRDM4Q9UKN5 801 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 NUP155O75694 1391 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 ATRNL1Q5VV63 1379 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 LY75O60449 1722 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 DOT1LQ8TEK3 1739 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 THSD7BQ9C0I4 1608 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 GAGE12BA1L429 117 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 DIRC3C9JPN6 131 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PHF2O75151 1096 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 MGAT1P26572 445 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 BMPR1AP36894 532 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 FLT3LGP49771 235 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 CLRN1P58418 232 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 RAP2BP61225 183 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 TMPRSS15P98073 1019 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PPP3CAQ08209 521 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 RESTQ13127 1097 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 STAT4Q14765 748 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 MUM1Q2TAK8 710 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 TOR2AQ5JU69 321 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 CASC1Q6TDU7 716 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 KRBA2Q6ZNG9 492 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 LCORLQ8N3X6 602 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 AUTS2Q8WXX7 1259 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 LDAHQ9H6V9 325 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 IFT122Q9HBG6 1241 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 SYBUQ9NX95 663 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 SCOCQ9UIL1 159 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 INSL6Q9Y581 213 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 KIF13BQ9NQT8 1826 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 WDR17Q8IZU2 1322 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PJA2O43164 708 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 ZFPL1O95159 310 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 SPDEFO95238 335 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 EYA4O95677 639 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 C1RP00736 705 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 ELANEP08246 267 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 HSD3B2P26439 372 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 SOX5P35711 763 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 SREBF1P36956 1147 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PLA2G5P39877 138 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 GPR3P46089 330 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PTH2RP49190 550 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 USP14P54578 494 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PER3P56645 1201 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 GUCY1B3Q02153 619 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 GRM1Q13255 1194 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 NOMO1Q15155 1222 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 LONRF3Q496Y0 759 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 TSHZ3Q63HK5 1081 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 AFMIDQ63HM1 303 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 SDE2Q6IQ49 451 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 MED25Q71SY5 747 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 SMC5Q8IY18 1101 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PQLC1Q8N2U9 271 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 OR7D4Q8NG98 312 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 CHAC2Q8WUX2 184 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 ASB10Q8WXI3 467 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 FATE1Q969F0 183 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PRAM1Q96QH2 718 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 BCO1Q9HAY6 547 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa3.68□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 SBF1O95248 1867 aa3.67□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC7Q96M83 1385 aa3.67□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa3.67□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 A0A0G2JLW4 131 aa3.67□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PIPSLA2A3N6 862 aa3.67□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC78A2IDD5 438 aa3.67□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 MARCH11A6NNE9 402 aa3.67□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 BRINP1O60477 761 aa3.67□□□□□ -1.82
ATXN3-211ENST00000511362 PRKD3O94806 890 aa3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms