RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508350.1

CDH18-208, Transcript of cadherin 18, human

TSL 4

Gene CDH18, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDH18-208	ENST00000508350	LRMP	Q12912	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ORC1	Q13415	861 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ADAM15	Q13444	863 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NCOA4	Q13772	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SURF1	Q15526	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PSMD5	Q16401	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	STX1A	Q16623	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ZACN	Q401N2	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	RETREG3	Q86VR2	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	HLA-C	Q95604	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	REV3L	O60673	3130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NCOR1	O75376	2440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	AXIN1	O15169	862 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	MAPK13	O15264	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TGM5	O43548	720 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	RFPL2	O75678	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CLSTN1	O94985	981 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	OAZ2	O95190	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SEC24A	O95486	1093 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CALCA	P01258	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	LMO2	P25791	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NDUFV1	P49821	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	MXI1	P50539	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	MMP16	P51512	607 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	KCNQ1	P51787	676 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CLCN4	P51793	760 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NR1H3	Q13133	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TRPC3	Q13507	836 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	KCNC3	Q14003	757 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	NCAPH	Q15003	741 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SV2C	Q496J9	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	USP37	Q86T82	979 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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