RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 NCANO14594 1321 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 CXCL8P10145 99 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 AGAP3Q96P47 875 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 DMAC2Q9NW81 257 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 WHRNQ9P202 907 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 FIS1Q9Y3D6 152 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 UMODL1Q5DID0 1318 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 FUKQ8N0W3 1084 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM33Q9UPN9 1127 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 COMMD10Q9Y6G5 202 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 CHRNB2P17787 502 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ARFIP2P53365 341 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 RAD23BP54727 409 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SARNPP82979 210 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SURF1Q15526 300 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 TTC13Q8NBP0 860 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PGM2Q96G03 612 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM237Q96Q45 408 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 NUDCD1Q96RS6 583 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 C17orf75Q9HAS0 396 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC24A3Q9HC58 644 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PHTF1Q9UMS5 762 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 DRD4P21917 467 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 EFNA5P52803 228 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 KDSRQ06136 332 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 GEN1Q17RS7 908 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 DCLK2Q8N568 766 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SNX25Q9H3E2 840 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SMYD3Q9H7B4 428 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 GLI3P10071 1580 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 DNM1LO00429 736 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 DCTN3O75935 186 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 KRT37O76014 449 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 FDX1P10109 184 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ARL4AP40617 200 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 GCNT1Q02742 428 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 TFDP2Q14188 446 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 CNGA2Q16280 664 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 CCNG2Q16589 344 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SLFN11Q7Z7L1 901 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXO36Q8NEA4 188 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 HELQQ8TDG4 1101 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PCYOX1Q9UHG3 505 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PNMA3Q9UL41 463 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 A8MXQ7 604 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SNX16P57768 344 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 CPB2Q96IY4 423 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP1R36Q96LQ0 422 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM111AQ96PZ2 611 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 OSBPL7Q9BZF2 842 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 HAUS5O94927 633 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 CFHP08603 1231 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPCQ03188 943 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 NME3Q13232 169 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC14Q49A88 953 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 TFDP3Q5H9I0 405 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF677Q86XU0 584 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 NSMCE1Q8WV22 266 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SCYL1Q96KG9 808 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 KLC2Q9H0B6 622 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 VPS11Q9H270 941 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 OGTO15294 1046 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 VTNP04004 478 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 GLRA2P23416 452 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCD1P33897 745 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PHKA2P46019 1235 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 COPS2P61201 443 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNJ2P63252 427 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 MAMLD1Q13495 774 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 RAPH1Q70E73 1250 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP24Q8N264 748 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP4R1Q8TF05 950 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM167AQ96KS9 214 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC4Q9HBW1 653 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 CST3P01034 146 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP1A2P05177 515 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 MAPTP10636 758 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 DSG3P32926 999 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 NAMPTP43490 491 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms