RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497622.1

FAM3C-205, Transcript of family with sequence similarity 3 member C, human

TSL 2

Gene FAM3C, Length 666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM3C-205	ENST00000497622	CCND1	P24385	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	CD6	P30203	668 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	DSC2	Q02487	901 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	TFF2	Q03403	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	NELL2	Q99435	816 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	GABRD	O14764	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	KIF20A	O95235	890 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	GNAI2	P04899	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	CHRM3	P20309	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	KEL	P23276	732 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	PHKA1	P46020	1223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	MTMR1	Q13613	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	KIF22	Q14807	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	MIER2	Q8N344	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM3C-205	ENST00000497622	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	CERS1	P27544	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	CTGF	P29279	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	PRDX5	P30044	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	USP37	Q86T82	979 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	FZD9	O00144	591 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	QSOX1	O00391	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	SLC16A6	O15403	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	PTGER1	P34995	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	PPM1D	O15297	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	DTNB	O60941	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	KATNA1	O75449	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	TUBA4A	P68366	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	TCF15	Q12870	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	ICE2	Q659A1	982 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622		M0QYG6	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	TLR5	O60602	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	LATS1	O95835	1130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	ONECUT2	O95948	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	BMP15	O95972	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	CYP2D6	P10635	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	JUP	P14923	745 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	PDC	P20941	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	EPHB2	P29323	1055 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	MPG	P29372	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	CYP2C18	P33260	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM3C-205	ENST00000497622	NOG	Q13253	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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