RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ICAM1P05362 532 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TARSP26639 723 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RENBPP51606 427 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 MXRA7P84157 204 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TMPRSS15P98073 1019 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CENPCQ03188 943 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 UBXN1Q04323 297 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 FAAP100Q0VG06 881 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PPA1Q15181 289 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ANO4Q32M45 955 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PPM1NQ8N819 430 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 DNERQ8NFT8 737 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 OR52K2Q8NGK3 314 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 MED30Q96HR3 178 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CALN1Q9BXU9 219 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 FUT8Q9BYC5 575 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 C12orf10Q9HB07 376 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TBX21Q9UL17 535 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TNKSO95271 1327 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCB11O95342 1321 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 MGAMO43451 1857 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ST8SIA5O15466 376 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TLL1O43897 1013 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF40O75150 1001 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 AMHP03971 560 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CSF2RAP15509 400 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 MX1P20591 662 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP2C18P33260 490 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ETV1P50549 477 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CCL23P55773 120 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CUL1Q13616 776 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 STXBP2Q15833 593 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF124Q15973 351 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 EEPD1Q7L9B9 569 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 HACE1Q8IYU2 909 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 NEK6Q9HC98 313 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 WASH6PQ9NQA3 447 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TNNQ9UQP3 1299 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 C15orf41Q9Y2V0 281 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 FADS3Q9Y5Q0 445 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRD1A4D1F6 860 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA8CPA6NN73 597 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 E9PMD0 336 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 NOP56O00567 594 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF213O14771 459 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 KMOO15229 486 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 HLA-DRAP01903 254 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RETP07949 1114 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ACRP10323 421 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CHRNB1P11230 501 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CPA1P15085 419 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS2P15880 293 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PORP16435 677 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 POLE2P56282 527 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 NR5A1Q13285 461 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 IKBKEQ14164 716 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 NR1D2Q14995 579 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CDONQ4KMG0 1287 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM240Q5SV17 173 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF16Q5VV41 709 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC51BQ86UW2 128 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC38A6Q8IZM9 456 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC47A1Q96FL8 570 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SIKE1Q9BRV8 207 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM5Q9C035 493 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT23Q9C075 422 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 L3MBTL1Q9Y468 752 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms