RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SNAPC2Q13487 334 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 LLGL1Q15334 1064 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 UAP1L1Q3KQV9 507 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 PLAC9Q5JTB6 97 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM240Q5SV17 173 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SLC4A10Q6U841 1118 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF778Q96MU6 729 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SIK2Q9H0K1 926 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 CDH19Q9H159 772 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 EHD3Q9NZN3 535 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.52□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SCGB1D2O95969 90 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 GJB1P08034 283 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 RHOP08100 348 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 CCT8P50990 548 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 GRM1Q13255 1194 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 RFKQ969G6 155 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 CNPPD1Q9BV87 410 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ACTRT3Q9BYD9 372 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ETAA1Q9NY74 926 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 POLHQ9Y253 713 aa4.51□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 LINC01548A6NM66 108 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ARIH2O95376 493 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 FTH1P19P0C7X4 201 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 EBLN1P0CF75 366 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ITGALP20701 1170 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 DSC2Q02487 901 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 BMPR2Q13873 1038 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 C3orf20Q8ND61 904 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 FKBP10Q96AY3 582 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 GPR35Q9HC97 309 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SERTAD4Q9NUC0 356 aa4.5□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 TSPAN6O43657 245 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 NXPH3O95157 252 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 PF4V1P10720 104 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 NDUFB7P17568 137 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ITGB6P18564 788 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 DRD4P21917 467 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 CCND1P24385 295 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 PIK3CGP48736 1102 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 TFF2Q03403 129 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF425Q6IV72 752 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 TPH2Q8IWU9 490 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 VGLL2Q8N8G2 317 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 FAM136AQ96C01 138 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SMOC2Q9H3U7 446 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SLAMF7Q9NQ25 335 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 RAD54BQ9Y620 910 aa4.49□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 TARM1B6A8C7 271 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 VPS4BO75351 444 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 FAM163BP0C2L3 166 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 RARBP10826 455 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 PRDX5P30044 214 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 CD6P30203 668 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 TBCCQ15814 346 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 CEP85Q6P2H3 762 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 MIER2Q8N344 545 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ATRIPQ8WXE1 791 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SEMA4CQ9C0C4 833 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 ANLNQ9NQW6 1124 aa4.48□□□□□ -1.69
NELFCD-210ENST00000490205 DKK3Q9UBP4 350 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms