RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 UROC1Q96N76 676 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 C11orf70Q9BRQ4 267 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 NUP85Q9BW27 656 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 MTA2O94776 668 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 FAM163BP0C2L3 166 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 CYP2C18P33260 490 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 STILQ15468 1287 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 ACOT1Q86TX2 421 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 O00370 1275 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 MMP8P22894 467 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 NOMO2Q5JPE7 1267 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 CLLU1OSQ5K130 101 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 MEI1Q5TIA1 1274 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 SLFN11Q7Z7L1 901 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 PDCL2Q8N4E4 241 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 SENP8Q96LD8 212 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 TLR10Q9BXR5 811 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 TBX21Q9UL17 535 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 SNX12Q9UMY4 172 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB3-210ENST00000489475 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 MICAL2O94851 1124 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 SLU7O95391 586 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 CXCL10P02778 98 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 WARSP23381 471 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 RRM1P23921 792 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 WDTC1Q8N5D0 677 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 PAAF1Q9BRP4 392 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 KANSL3Q9P2N6 904 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 NCK2O43639 380 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 CALB1P05937 261 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 FGFR1P11362 822 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 DSTYKQ6XUX3 929 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 PEX26Q7Z412 305 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 C12orf29Q8N999 325 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 RABGGTAQ92696 567 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 GOLPH3Q9H4A6 298 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 NME7Q9Y5B8 376 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 M0QYV0 167 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 B3GAT3O94766 335 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 PDGFRBP09619 1106 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 PRLRP16471 622 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 CAPN2P17655 700 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 PAX3P23760 479 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 PTP4A2Q12974 167 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 C2CD6Q53TS8 623 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 LCLAT1Q6UWP7 414 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 ERICH1Q86X53 443 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 C3orf58Q8NDZ4 430 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 HYOU1Q9Y4L1 999 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 CLTBP09497 229 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 WSCD1Q658N2 575 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 ABI1Q8IZP0 508 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 CRYBG2Q8N1P7 616 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 MNS1Q8NEH6 495 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 TNIP3Q96KP6 325 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 LRFN2Q9ULH4 789 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 TCP1P17987 556 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 C11orf63Q6NUN7 778 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 NECAB2Q7Z6G3 386 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM86AQ8N2M4 240 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 CARD6Q9BX69 1037 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 TSPAN16Q9UKR8 245 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 SRGAP2O75044 1071 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 LMO2P25791 158 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 RPS6KA1Q15418 735 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC26Q2I0M4 334 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 MSANTD4Q8NCY6 345 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 DPEP3Q9H4B8 488 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 AMFRQ9UKV5 643 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 SCINQ9Y6U3 715 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 TET1Q8NFU7 2136 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 TCTN1Q2MV58 587 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 OSBPL9Q96SU4 736 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 FAM49BQ9NUQ9 324 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 PARVAQ9NVD7 372 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB3-210ENST00000489475 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms