RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TMC8	Q8IU68	726 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRD	O14764	452 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TGFB1I1	O43294	461 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PI15	O43692	258 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGB3	P05106	788 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4Q2	P0C623	313 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	RFX1	P22670	979 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	FCAR	P24071	287 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PCSK1	P29120	753 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	DPYD	Q12882	1025 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ING5	Q8WYH8	240 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	IRF7	Q92985	503 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MSANTD3	Q96H12	275 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CA14	Q9ULX7	337 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		18.57	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	STK25	O00506	426 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MAN2B1	O00754	1011 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	NCAM2	O15394	837 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TNNC2	P02585	160 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMC3	P17980	439 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC25C	P30307	473 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	AP3M2	P53677	418 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MYL7	Q01449	175 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNB1	Q14721	858 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PJA1	Q8NG27	643 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SMARCE1	Q969G3	411 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	GSDMA	Q96QA5	445 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SIX4	Q9UIU6	781 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ANK1	P16157	1881 aa		18.56	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424		H0Y858	1186 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	KLRC4	O43908	158 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MYL4	P12829	197 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT7B	P56706	349 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMD6	Q15008	389 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	POTEH	Q6S545	545 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	HPS3	Q969F9	1004 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	KXD1	Q9BQD3	176 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	L1RE1	Q9UN81	338 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		18.55	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOBTB3	O94955	611 aa		18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PNOC	Q13519	176 aa		18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		18.54	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		18.54	■□□□□ 0.56

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