RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485567.1

FN1-222, Transcript of fibronectin 1, human

TSL 1 (best)

Gene FN1, Length 584 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FN1-222	ENST00000485567	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567		E7ENX8	843 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	NPC1	O15118	1278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TRIM13	O60858	407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SOAT2	O75908	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	FCER1A	P12319	257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	IDE	P14735	1019 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ACVR2A	P27037	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GABRB3	P28472	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	HHEX	Q03014	270 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TAP2	Q03519	686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	BIRC3	Q13489	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	IQCB1	Q15051	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	NPY5R	Q15761	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	INSC	Q1MX18	579 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MED15	Q96RN5	788 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SMO	Q99835	787 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SYT5	O00445	386 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PODXL	O00592	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PLAT	P00750	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	HK1	P19367	917 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	CFP	P27918	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SERPINF1	P36955	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	RABGGTB	P53611	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SATB1	Q01826	763 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	RAB30	Q15771	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GGT6	Q6P531	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ZNF536	O15090	1300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567		A0A087WZ62	844 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	FOXS1	O43638	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	NDST3	O95803	873 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	LRPAP1	P30533	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	CNR2	P34972	360 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	CPT1A	P50416	773 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	NHLH2	Q02577	135 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	ZNF124	Q15973	351 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	ALF	Q53S48	1182 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FN1-222	ENST00000485567	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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