RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 THEM5Q8N1Q8 247 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 GIPC2Q8TF65 315 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 MSANTD3Q96H12 275 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM84AQ96KN4 292 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 GTSE1Q9NYZ3 720 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A087X0B3 334 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 KPNA7A9QM74 516 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 DPYSL4O14531 572 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 GCNT3O95395 438 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 GAP43P17677 238 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CDC25CP30307 473 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CTHP32929 405 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 TXLNAP40222 546 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 POSTNQ15063 836 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SV2BQ7L1I2 683 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 BRSK2Q8IWQ3 736 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 STKLD1Q8NE28 680 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SPPL2BQ8TCT7 592 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF560Q96MR9 790 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 GCNAQ96QF7 691 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 ACCSQ96QU6 501 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 TASP1Q9H6P5 420 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 TMLHEQ9NVH6 421 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 OBP2AQ9NY56 170 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.25■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 ITGB3P05106 788 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SYT1P21579 422 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR15P49685 360 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 NRLP54845 237 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 TNK2Q07912 1038 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 DMWDQ09019 674 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC32Q14392 662 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP2R5DQ14738 602 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 LPAL2Q16609 132 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SCARA3Q6AZY7 606 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 NT5DC4Q86YG4 428 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 C1orf127Q8N9H9 656 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 BPIFB1Q8TDL5 484 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 OLFML3Q9NRN5 406 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 DLL3Q9NYJ7 618 aa18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SPTBN2O15020 2390 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 IDEP14735 1019 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 WEE1P30291 646 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PNPLA4P41247 253 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 STAT6P42226 847 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CXCL12P48061 93 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SMARCB1Q12824 385 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 TAF12Q16514 161 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM150AQ86TG1 271 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PDCL2Q8N4E4 241 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SPEM1Q8N4L4 309 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 USP28Q96RU2 1077 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CBWD1Q9BRT8 395 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC46A2Q9BY10 475 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 C2orf42Q9NWW7 574 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 L1RE1Q9UN81 338 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 AGAP1Q9UPQ3 857 aa18.23■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 FRMD3A2A2Y4 597 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 GOLGA8IPA6NC78 632 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 GOLGA8JA6NMD2 632 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 TSPY1Q01534 308 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PON2Q15165 354 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CXorf38Q8TB03 319 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PANK2Q9BZ23 570 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PARD6AQ9NPB6 346 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CCL26Q9Y258 94 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.22■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 GARTP22102 1010 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 TGM1P22735 817 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 HOXC13P31276 330 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 FNTBP49356 437 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 NLRP12P59046 1061 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PLCB2Q00722 1185 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 BFSP1Q12934 665 aa18.21■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC142Q17RM4 750 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms