RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478804.3

MBD5-208, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 5, human

TSL 5

Gene MBD5, Length 592 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MBD5-208	ENST00000478804	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	RGMA	Q96B86	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	IPP	Q9Y573	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	ZNF213	O14771	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	GNAI3	P08754	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CYP2D6	P10635	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CD6	P30203	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CYP2C19	P33261	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	EVA1C	P58658	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	GNAI1	P63096	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CLUL1	Q15846	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CLSTN1	O94985	981 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	MMP13	P45452	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	TCF15	Q12870	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	JADE3	Q92613	823 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804		H0YIZ8	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	F2RL2	O00254	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	C5AR1	P21730	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	EDNRB	P24530	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	PLCD1	P51178	756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	IL10RA	Q13651	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	NELL2	Q99435	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	QSOX1	O00391	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	INSIG1	O15503	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	DNAJB5	O75953	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	GJB1	P08034	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	MAL	P21145	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CNGA1	P29973	690 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CCKBR	P32239	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	NR4A2	P43354	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	IGBP1	P78318	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	VPS16	Q9H269	839 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	ONECUT2	O95948	504 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MBD5-208	ENST00000478804	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms