RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC66A2RUB6 948 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DLL1O00548 723 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KCNK3O14649 394 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPOPO43791 374 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ERLIN1O75477 346 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 THP07101 528 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RAG1P15918 1043 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANK1P16157 1881 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CETN2P41208 172 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC8A3P57103 927 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CNGA2Q16280 664 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PALB2Q86YC2 1186 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 APPL2Q8NEU8 664 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CXorf38Q8TB03 319 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TNIP3Q96KP6 325 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 UROC1Q96N76 676 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TOX2Q96NM4 488 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HESX1Q9UBX0 185 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 POLIQ9UNA4 740 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HES2Q9Y543 173 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A0U1RQF3 1178 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KPNA7A9QM74 516 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PIRO00625 290 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SETSIPP0DME0 302 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GHRP10912 638 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ITGB8P26012 769 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LRPAP1P30533 357 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RAD23BP54727 409 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF394Q53GI3 561 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HES6Q96HZ4 224 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CARD9Q9H257 536 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ABCB6Q9NP58 842 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ACP6Q9NPH0 428 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EOMESO95936 686 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MMP8P22894 467 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CD52P31358 61 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NDST1P52848 882 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LPIN1Q14693 890 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MESDQ14696 234 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ELF2Q15723 593 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MON1BQ7L1V2 547 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CREG2Q8IUH2 290 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPATA18Q8TC71 538 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GUCD1Q96NT3 240 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RSAD1Q9HA92 442 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KLK14Q9P0G3 267 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ALG6Q9Y672 507 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A8MXQ7 604 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC188H7C350 402 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KIAA0355O15063 1070 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NCK2O43639 380 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CEP104O60308 925 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SRGAP2O75044 1071 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CKBP12277 381 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SELPP16109 830 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms