RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 CHST7Q9NS84 486 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 CEP83Q9Y592 693 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.9□□□□□ -1.3
CTPS1-207ENST00000475060 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 O00370 1275 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 EBAG9O00559 213 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 DPYSL4O14531 572 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 LIASO43766 372 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TJP3O95049 919 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TTC4O95801 387 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 KRT7P08729 469 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 FAM163BP0C2L3 166 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 IQCF3P0C7M6 154 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 STAG3L1P0CL83 205 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 RALAP11233 206 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 VDRP11473 427 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 P4HA1P13674 534 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 INSRRP14616 1297 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TSHRP16473 764 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TMOD1P28289 359 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 HOXC8P31273 242 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 CDKN2BP42772 138 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 CDR1P51861 262 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 GTF2A2P52657 109 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 OGDHQ02218 1023 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 KRT17Q04695 432 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 PDCLQ13371 301 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TRPC3Q13507 836 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 PRKG1Q13976 671 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 SLC29A2Q14542 456 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 ZBTB6Q15916 424 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 CNGA2Q16280 664 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 KRT71Q3SY84 523 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 PKDCCQ504Y2 493 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 XKR4Q5GH76 650 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 BBS12Q6ZW61 710 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 ARCQ7LC44 396 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 NLRP14Q86W24 1093 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TDRPQ86YL5 185 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 ALLCQ8N6M5 410 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TTC13Q8NBP0 860 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 STK32AQ8WU08 396 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TFAP2BQ92481 460 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 P3H4Q92791 437 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 FAM84AQ96KN4 292 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 SYT17Q9BSW7 474 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 MIS12Q9H081 205 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 CYLDQ9NQC7 956 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 KAT6AQ92794 2004 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 A6NJR5 290 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 E7ESA3 106 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 MYO1CO00159 1063 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 B4GALT5O43286 388 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 TSPAN1O60635 241 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 LRCH4O75427 683 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 FAM155BO75949 473 aa6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CTPS1-207ENST00000475060 F2P00734 622 aa6.88□□□□□ -1.31
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