RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 PPP3CBP16298 524 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 ADRA1BP35368 520 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 NDUFV1P49821 464 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TAP2Q03519 686 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 MAEAQ7L5Y9 396 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 FAM227AF5H4B4 570 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 ESRRBO95718 433 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 GRPP07492 148 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 COL10A1Q03692 680 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 HESX1Q9UBX0 185 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 DMTF1Q9Y222 760 aa8.53□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 A0A0B4J269 797 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 YY2O15391 372 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 ZNF134P52741 427 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 GPSM2P81274 684 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 TUBB3Q13509 450 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 OBP2AQ9NY56 170 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 MED16Q9Y2X0 877 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa8.52□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 CFAP69A5D8W1 941 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 DCLK1O15075 740 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 PEX1O43933 1283 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 RHOBTB3O94955 611 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 SRGNP10124 158 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 ITGALP20701 1170 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 UCP3P55916 312 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 VWA1Q6PCB0 445 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 IL31RAQ8NI17 732 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 TRIM54Q9BYV2 358 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 L1RE1Q9UN81 338 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 USP19O94966 1318 aa8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 TYRP1P17643 537 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 SLC7A1P30825 629 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 LONRF3Q496Y0 759 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 VPS53Q5VIR6 699 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 FAM156AQ8NDB6 213 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 TFAP2BQ92481 460 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 FBXL20Q96IG2 436 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.5□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 TRIAP1O43715 76 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 RHOP08100 348 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 CHRM2P08172 466 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 SLC11A2P49281 568 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 ARFIP2P53365 341 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 APOA5Q6Q788 366 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 TIFAQ96CG3 184 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 XPR1Q9UBH6 696 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.49□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 BTN3A1O00481 513 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 TPP1O14773 563 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 TBX3O15119 743 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 CD6P30203 668 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 CXCR5P32302 372 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 LILRA4P59901 499 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 GALEQ14376 348 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 GBX1Q14549 363 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 SLC15A4Q8N697 577 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 TMX2Q9Y320 296 aa8.48□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 PROM1O43490 865 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 SOAT2O75908 522 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 PDHA1P08559 390 aa8.47□□□□□ -1.05
SGCE-210ENST00000472326 FOLR3P41439 243 aa8.47□□□□□ -1.05
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