RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 GGT7Q9UJ14 662 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PADI4Q9UM07 663 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SOX13Q9UN79 622 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 K7EPI3 171 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 APOL1O14791 398 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 TBX10O75333 385 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 GYPCP04921 128 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 GFAPP14136 432 aa6.92□□□□□ -1.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 ITGAXP20702 1163 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 JAK1P23458 1154 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 RCVRNP35243 200 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 RFC4P35249 363 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 HNF1BP35680 557 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC9A3P48764 834 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ETV1P50549 477 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 RAP1GDS1P52306 607 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PLTPP55058 493 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 KRT32Q14532 448 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 DSC3Q14574 896 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SPA17Q15506 151 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 NPTX1Q15818 432 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PTPN21Q16825 1174 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIM16LQ309B1 348 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SHEQ5VZ18 495 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.39e-34■□□□□ 10.3
RABGGTB-208ENST00000471759 TTLQ8NG68 377 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SVIPQ8NHG7 77 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SGK3Q96BR1 496 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 CEP170P1Q96L14 293 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 NLRP3Q96P20 1036 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.92□□□□□ -1.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 MBD2Q9UBB5 411 aa6.92□□□□□ -1.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 GSTM1P09488 218 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 RSPH10BP0C881 870 aa6.91□□□□□ -1.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 EPHB2P29323 1055 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 STX2P32856 288 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC26A3P40879 764 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SSTP61278 116 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 DAB2P98082 770 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGAP4P98171 946 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.91□□□□□ -1.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.91□□□□□ -1.3
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RABGGTB-208ENST00000471759 BTBD9Q96Q07 612 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 SIAEQ9HAT2 523 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-208ENST00000471759 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.91□□□□□ -1.3
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