RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 KCNK12Q9HB15 430 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 TECTAO75443 2155 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 CETN3O15182 167 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 KRT13P13646 458 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 PCSK1P29120 753 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 CDR1P51861 262 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 STIM1Q13586 685 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ZACNQ401N2 412 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ISM2Q6H9L7 571 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF197O14709 1029 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 SOAT2O75908 522 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 ENPEPQ07075 957 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 TDGQ13569 410 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 LEMD2Q8NC56 503 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 NXPE3Q969Y0 559 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 LRFN3Q9BTN0 628 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 ASAH2Q9NR71 780 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 TMLHEQ9NVH6 421 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 ASB3Q9Y575 518 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.32■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 PRR33A8MZF0 331 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 PSMA7O14818 248 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 HCRTO43612 131 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 CLSTN1O94985 981 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 VNN1O95497 513 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 FAM163BP0C2L3 166 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R2P41236 205 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC63Q05C16 580 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 SIGLEC14Q08ET2 396 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF699Q32M78 642 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 PRSS36Q5K4E3 855 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 SV2AQ7L0J3 742 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 ING5Q8WYH8 240 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 PKMYT1Q99640 499 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.31■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 ANHXE9PGG2 379 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 TACC1O75410 805 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 MICAL2O94851 1124 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM49P0CI25 452 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM49CP0CI26 452 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 CEBPBP17676 345 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 LMO2P25791 158 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 EPHA5P54756 1037 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 MORC3Q14149 939 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 TCEAL4Q96EI5 215 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 SNX25Q9H3E2 840 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 GDE1Q9NZC3 331 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 CDH9Q9ULB4 789 aa21.3■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM221A6NGB7 291 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 M0R296 226 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 BIN1O00499 593 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 MYL4P12829 197 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 BMP6P22004 513 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 CCNE1P24864 410 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 CCR2P41597 374 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 HTR4Q13639 388 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 VEPH1Q14D04 833 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 FAM171BQ6P995 826 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 MTSS1LQ765P7 747 aa21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CTPS1-206ENST00000470271 ITIH5Q86UX2 942 aa21.29■■□□□ 1
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