RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 GRM5P41594 1212 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 RBP5P82980 135 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 IFFO1Q0D2I5 559 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 PTPN20Q4JDL3 420 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 LRRC31Q6UY01 552 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM176AQ96HP8 235 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 WHRNQ9P202 907 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ASIC3Q9UHC3 531 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 A6NJR5 290 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 F8VP50 259 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 IVLP07476 585 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 FGFR4P22455 802 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 IRAK1P51617 712 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CDC42EP1Q00587 391 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 OGDHQ02218 1023 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ORC1Q13415 861 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 PTK6Q13882 451 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CCNG2Q16589 344 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 EMC10Q5UCC4 262 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 NIPA2Q8N8Q9 360 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ATL2Q8NHH9 583 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC114Q96M63 670 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 TWNKQ96RR1 684 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ELOVL4Q9GZR5 314 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 RRAGCQ9HB90 399 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 HMGXB4Q9UGU5 601 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CITO14578 2027 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 STAU1O95793 577 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 KRT1P04264 644 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 NUDT17P0C025 328 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ATP1A2P50993 1020 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 GNGT1P63211 74 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 SLMAPQ14BN4 828 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 MORN1Q5T089 497 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 AGBL2Q5U5Z8 902 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 DENND2CQ68D51 928 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 KIF12Q96FN5 646 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 KLHL11Q9NVR0 708 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CYTH4Q9UIA0 394 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 GINS2Q9Y248 185 aa18.15■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 NRCAMQ92823 1304 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 GOLGA8SH3BPF8 625 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 F2P00734 622 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 TCF4P15884 667 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 MAP2K5Q13163 448 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 IRF5Q13568 498 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 ODF2Q5BJF6 829 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 SLITRK1Q96PX8 696 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 EPB41L4BQ9H329 900 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 SYNCQ9H7C4 482 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 WDR35Q9P2L0 1181 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 SIGLEC16A6NMB1 481 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 NPTXRO95502 500 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 KRT3P12035 628 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 KRT71Q3SY84 523 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 TTC39CQ8N584 583 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 SNF8Q96H20 258 aa18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 PI4K2BG5E9Z4 385 aa18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 MICAL2O94851 1124 aa18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 VDRP11473 427 aa18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 ITIH2P19823 946 aa18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 GSCP56915 257 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 HOOK3Q86VS8 718 aa18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 M0QYV0 167 aa18.12■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 GPR32O75388 356 aa18.12■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 TJP3O95049 919 aa18.12■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 HMGCRP04035 888 aa18.12■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 ATF2P15336 505 aa18.12■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 PSMA2P25787 234 aa18.12■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
FAAP20-211ENST00000469733 COPS2P61201 443 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms