RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
LINC00888-201ENST00000468380 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.27■□□□□ 0.84
LINC00888-201ENST00000468380 AKAP13Q12802 2813 aa20.27■□□□□ 0.84
LINC00888-201ENST00000468380 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.26■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 IL17AQ16552 155 aa20.26■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.26■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.26■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.26■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.26■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.26■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.26■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 INVSQ9Y283 1065 aa20.26■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 LNP1A1A4G5 178 aa20.25■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 CDC25CP30307 473 aa20.25■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.25■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.25■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.25■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 FAM189A1O60320 539 aa20.24■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 RHOBTB1O94844 696 aa20.24■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 F11P03951 625 aa20.24■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ADRB2P07550 413 aa20.24■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 PLS3P13797 630 aa20.24■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 GUCY2CP25092 1073 aa20.24■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 SPATA1Q5VX52 437 aa20.24■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.24■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 GATA6Q92908 595 aa20.24■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 EBF1Q9UH73 591 aa20.24■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 TBX20Q9UMR3 447 aa20.24■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 CYP11A1P05108 521 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ANK1P16157 1881 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 DRD1P21728 446 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ANAPC15P60006 121 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 VEPH1Q14D04 833 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ELF2Q15723 593 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 TXNDC8Q6A555 127 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 SYT13Q7L8C5 426 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 C8orf76Q96K31 380 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.23■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 PATE3B3GLJ2 98 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 PIRO00625 290 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 APBB3O95704 486 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ODC1P11926 461 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 GJA4P35212 333 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 NLRP12P59046 1061 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 DMC1Q14565 340 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 KRT79Q5XKE5 535 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 STKLD1Q8NE28 680 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 GCNAQ96QF7 691 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 TIPINQ9BVW5 301 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 TDP1Q9NUW8 608 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 STK24Q9Y6E0 443 aa20.22■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 NUP205Q92621 2012 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ANTXRLA6NF34 631 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 CEACAM1P13688 526 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 AVPR1AP37288 418 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 TRAPPC10P48553 1259 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 SMTNP53814 917 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 TAF12Q16514 161 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 JADE1Q6IE81 842 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.21■□□□□ 0.83
LINC00888-201ENST00000468380 ANO9A1A5B4 782 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 GBP1P32455 592 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 GPR15P49685 360 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 IRX4P78413 519 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 BFSP1Q12934 665 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 FBXO43Q4G163 708 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 FAM212AQ96EL1 285 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 BICD1Q96G01 975 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 PNMA5Q96PV4 448 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 ECT2Q9H8V3 914 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
LINC00888-201ENST00000468380 SCN1AP35498 2009 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms