RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466579.1

SDCCAG3-208, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, human

TSL 1 (best)

Gene SDCCAG3, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDCCAG3-208	ENST00000466579	XYLB	O75191	536 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MICAL2	O94851	1124 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MBD3	O95983	291 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HLA-DRA	P01903	254 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PCSK1	P29120	753 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ELF1	P32519	619 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GCLM	P48507	274 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EPHA5	P54756	1037 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ARPP19	P56211	112 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BIRC3	Q13489	604 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF699	Q32M78	642 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KRT39	Q6A163	491 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SLC35C1	Q96A29	364 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BCO2	Q9BYV7	579 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ABCB6	Q9NP58	842 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CDH9	Q9ULB4	789 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NR2E1	Q9Y466	385 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	YIPF1	Q9Y548	306 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NME7	Q9Y5B8	376 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DLL1	O00548	723 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PRRG1	O14668	218 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CCL16	O15467	120 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GNA14	O95837	355 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LMO2	P25791	158 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NLRP12	P59046	1061 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TNNC1	P63316	161 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TSPY1	Q01534	308 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DUSP4	Q13115	394 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PLD1	Q13393	1074 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LRRC3	Q9BY71	257 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SDCBP2	Q9H190	292 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CEP72	Q9P209	647 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	POLI	Q9UNA4	740 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ASB3	Q9Y575	518 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MYO10	Q9HD67	2058 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HCRT	O43612	131 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LRG1	P02750	347 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	P4HA1	P13674	534 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PTPN2	P17706	415 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PIK3CA	P42336	1068 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MAGEA11	P43364	429 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ASPA	P45381	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MXI1	P50539	228 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	STX17	P56962	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	INCA1	Q0VD86	236 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TWF1	Q12792	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CBWD6	Q4V339	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RNF135	Q8IUD6	432 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LEMD2	Q8NC56	503 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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