RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457718.5

TNS3-208, Transcript of tensin 3, human

TSL 5

Gene TNS3, Length 3,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS3-208	ENST00000457718	CENPC	Q03188	943 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CRYM	Q14894	314 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CCNG2	Q16589	344 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	RAPH1	Q70E73	1250 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	RSPH3	Q86UC2	560 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	RNF19A	Q9NV58	838 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	PDGFRA	P16234	1089 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CHRNB2	P17787	502 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718		Q3C1V9	767 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	MCM8	Q9UJA3	840 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	PIK3CD	O00329	1044 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	SLC26A4	O43511	780 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	KRT7	P08729	469 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	GPC3	P51654	580 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	NRL	P54845	237 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CENPT	Q96BT3	561 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.43	□□□□□ -0.58	5e-6	■□□□□ 10.7
TNS3-208	ENST00000457718	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	EXTL3	O43909	919 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CCDC22	O60826	627 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CFH	P08603	1231 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	KCNA3	P22001	575 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	COL20A1	Q9P218	1284 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	TAF1	P21675	1872 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	STAMBP	O95630	424 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CHI3L2	Q15782	390 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	STXBP2	Q15833	593 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CDHR1	Q96JP9	859 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	LRRC19	Q9H756	370 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	PTK6	Q13882	451 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	MTFR1	Q15390	333 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	XKR3	Q5GH77	459 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	NETO2	Q8NC67	525 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	KLC2	Q9H0B6	622 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	SENP1	Q9P0U3	644 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	GGA2	Q9UJY4	613 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	NEMP1	O14524	444 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	MED7	O43513	233 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CYP1A2	P05177	515 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	P4HA1	P13674	534 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	SERPINB4	P48594	390 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	PGM5	Q15124	567 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	BSND	Q8WZ55	320 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNS3-208	ENST00000457718	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.42	□□□□□ -0.58

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