RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457025.5

CCDC18-AS1-222, CCDC18 antisense RNA 1, human

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 413 nt, Biotype antisense RNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	USP8	P40818	1118 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	RGS19	P49795	217 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PDE6C	P51160	858 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CDH8	P55286	799 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	BCAR1	P56945	870 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	STIL	Q15468	1287 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GPR65	Q8IYL9	337 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	TTC13	Q8NBP0	860 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	WHAMM	Q8TF30	809 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CCDC42	Q96M95	316 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ZNF558	Q96NG5	402 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CHP1	Q99653	195 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	AAAS	Q9NRG9	546 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MARCH5	Q9NX47	278 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	LTBP2	Q14767	1821 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CIT	O14578	2027 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SCN5A	Q14524	2016 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	LCA5L	O95447	670 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	EFEMP2	O95967	443 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	VDR	P11473	427 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CD58	P19256	250 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PCSK1	P29120	753 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	RAP1GAP	P47736	663 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	NDST1	P52848	882 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	RAD23B	P54727	409 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CDR2	Q01850	454 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ARID5A	Q03989	594 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	WSCD1	Q658N2	575 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	METTL23	Q86XA0	190 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	FIBCD1	Q8N539	461 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	IGSF21	Q96ID5	467 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	TNIP3	Q96KP6	325 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GDF15	Q99988	308 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SNX25	Q9H3E2	840 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	10.72	□□□□□ -0.69	9e-8	■■■■■ 29.7
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	COL4A6	Q14031	1691 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ANK1	P16157	1881 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025		A8MXQ7	604 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	MED7	O43513	233 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ATP8B3	O60423	1300 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	OAZ2	O95190	189 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	NDUFA10	O95299	355 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ITGB1	P05556	798 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GZMA	P12544	262 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	FGFR3	P22607	806 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	GNA15	P30679	374 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	BRCC3	P46736	316 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	CNGA2	Q16280	664 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SLC18A3	Q16572	532 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	FUT10	Q6P4F1	479 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	ALPK3	Q96L96	1907 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
CCDC18-AS1-222	ENST00000457025	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69

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