RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435497.1

LINC00028-201, long intergenic non-protein coding RNA 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00028, Length 587 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00028-201ENST00000435497 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 KBTBD6Q86V97 674 aa14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 RIN3Q8TB24 985 aa14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 GAB3Q8WWW8 586 aa14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 LOXL4Q96JB6 756 aa14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 FIZ1Q96SL8 496 aa14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 REEP2Q9BRK0 252 aa14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 CCL26Q9Y258 94 aa14.72□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 LAMA1P25391 3075 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 EPN2O95208 641 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 F11P03951 625 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 PAX3P23760 479 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 PMLP29590 882 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 CDC25CP30307 473 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 ZNF131P52739 623 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 CD302Q8IX05 232 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.71□□□□□ -0.05
LINC00028-201ENST00000435497 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.71□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TISP43B9A030 160 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 CYB561D2O14569 222 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ACOT2P49753 483 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 RUNX3Q13761 415 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 WSCD1Q658N2 575 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 IL31Q6EBC2 164 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 GPBP1Q86WP2 473 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 MYCT1Q8N699 235 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 EBF3Q9H4W6 596 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 DERAQ9Y315 318 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TCHHQ07283 1943 aa14.7□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 K7ENM7 598 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TRAK2O60296 914 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 EGFP01133 1207 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ARSAP15289 507 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 KCNA4P22459 653 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 GALK1P51570 392 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 NLRP12P59046 1061 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 GTF2BQ00403 316 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 VEPH1Q14D04 833 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 STPG1Q5TH74 334 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TXNDC8Q6A555 127 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 MCTP1Q6DN14 999 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 STKLD1Q8NE28 680 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ASB7Q9H672 318 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 DSEQ9UL01 958 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 OBSL1O75147 1896 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.69□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 FRYQ5TBA9 3013 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 RNF40O75150 1001 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 FAM13AO94988 1023 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 GPR15P49685 360 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 TAF6P49848 677 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 SMARCB1Q12824 385 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 MCM6Q14566 821 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 PTPAQ15257 358 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 METTL23Q86XA0 190 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LINC00028-201ENST00000435497 GCNAQ96QF7 691 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms