RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429968.5

RBM39-212, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,149 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-212ENST00000429968 AKT3Q9Y243 479 aa14.77□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CEP350Q5VT06 3117 aa14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 RARGP13631 454 aa14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ETS1P14921 441 aa14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CD19P15391 556 aa14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 EXD1Q8NHP7 514 aa14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 HAUS1Q96CS2 278 aa14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CPXM1Q96SM3 734 aa14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 BRCA2P51587 3418 aa14.76□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 NDUFAB1O14561 156 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ACSL3O95573 720 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 IL1R2P27930 398 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 MAN1A1P33908 653 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ODF2Q5BJF6 829 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ERICH1Q86X53 443 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 EMC1Q8N766 993 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PLVAPQ9BX97 442 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 FAM107BQ9H098 131 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 RNF19AQ9NV58 838 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 WHRNQ9P202 907 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ERLIN2O94905 339 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 GH1P01241 217 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 KRT1P04264 644 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ERBB2P04626 1255 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CALB1P05937 261 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SMPD1P17405 629 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 LAMC2Q13753 1193 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SURF1Q15526 300 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 QPCTQ16769 361 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CCDC38Q502W7 563 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 RAB6CQ53S08 254 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ILDR2Q71H61 639 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 NLRP14Q86W24 1093 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PPTC7Q8NI37 304 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SNF8Q96H20 258 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PARP2Q9UGN5 583 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.75□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CYP3A5P20815 502 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 KLRC2P26717 231 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PHKA2P46019 1235 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CCNG2Q16589 344 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CCL15Q16663 113 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 FAM187BQ17R55 369 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 LONRF1Q17RB8 773 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 C3orf20Q8ND61 904 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ATL2Q8NHH9 583 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 E7EVH7 732 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 PIK3R2O00459 728 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 ASAP2O43150 1006 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 TSPAN1O60635 241 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CREB1P16220 341 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 CALCOCO2Q13137 446 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 TAF5Q15542 800 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.74□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 GLTPD2A6NH11 291 aa14.73□□□□□ -0.05
RBM39-212ENST00000429968 H3BRB1 525 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms