RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SAAL1Q96ER3 474 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 CUEDC2Q9H467 287 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 DMXL1Q9Y485 3027 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 LILRB5O75023 590 aa22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ITGB3P05106 788 aa22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 MTAPQ13126 283 aa22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 CXorf38Q8TB03 319 aa22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 TASP1Q9H6P5 420 aa22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 IL21Q9HBE4 155 aa22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 TSPY1Q01534 308 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 STK38Q15208 465 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 E2F4Q16254 413 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 GPR158Q5T848 1215 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 GCNAQ96QF7 691 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.6■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 CHRNB1P11230 501 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ID4P47928 161 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2R5DQ14738 602 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 GPD1LQ8N335 351 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ACBD6Q9BR61 282 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 PANK2Q9BZ23 570 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 EPC1Q9H2F5 836 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ABCB6Q9NP58 842 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 L1RE1Q9UN81 338 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.59■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 OBSL1O75147 1896 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 SOBPA7XYQ1 873 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 DPYSL4O14531 572 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 SPTLC2O15270 562 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 YEATS4O95619 227 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 TDGF1P13385 188 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 PLCB2Q00722 1185 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 PDILTQ8N807 584 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM9Q9C026 710 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.58■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 F5P12259 2224 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 HUS1O60921 280 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CCNE1P24864 410 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CCR3P51677 355 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CYP4F8P98187 520 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 TAF12Q16514 161 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SNX21Q969T3 373 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 PKMYT1Q99640 499 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF12O95522 483 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 NRLP54845 237 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 RBP5P82980 135 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 AMPD3Q01432 767 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 MYL7Q01449 175 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC32Q14392 662 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 SURF1Q15526 300 aa22.56■■□□□ 1.2
LIMS1-208ENST00000428064 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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