RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT10P13645 584 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CA4P22748 312 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 SESN3P58005 492 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CTC1Q2NKJ3 1217 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 KAZNQ674X7 775 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP128Q6ZU80 1094 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 C4orf19Q8IY42 314 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXL18Q96ME1 805 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXP3Q9BZS1 431 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 VCXQ9H320 206 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 KMT5AQ9NQR1 393 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNG1Q9UIX4 513 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 NUMBLQ9Y6R0 609 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF536O15090 1300 aa19.33■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PSTPIP1O43586 416 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PTP4A2Q12974 167 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 HHATQ5VTY9 493 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 OR52E8Q6IFG1 317 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 SPOPLQ6IQ16 392 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CLNKQ7Z7G1 428 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM160B2Q86V87 743 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF516Q92618 1163 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 NPHS2Q9NP85 383 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 SENP1Q9P0U3 644 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNE2O96020 404 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ASNSP08243 561 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ETS1P14921 441 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC6Q16204 474 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF220Q5VTB9 566 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ANO5Q75V66 913 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM11Q96F44 468 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR35Q9P2L0 1181 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 DNPEPQ9ULA0 475 aa19.32■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TYROBPO43914 113 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ICAM1P05362 532 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TCF4P15884 667 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF2H1P32780 548 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PTGER2P43116 358 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMC5P62195 406 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 MAMLD1Q13495 774 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 KATNAL2Q8IYT4 538 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CPXCR1Q8N123 301 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFAND2BQ8WV99 257 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 CLEC4DQ8WXI8 215 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TIPINQ9BVW5 301 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 HACL1Q9UJ83 578 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 FEM1BQ9UK73 627 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 FZD1Q9UP38 647 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 LRCH1Q9Y2L9 728 aa19.31■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX30Q5VWJ9 437 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 DSTYKQ6XUX3 929 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 USP37Q86T82 979 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 GPD1LQ8N335 351 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 NRG4Q8WWG1 115 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC25Q96NG3 672 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFB129Q9H1M3 183 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF541Q9H0D2 1346 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PPM1 405 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 RCN1Q15293 331 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 FYB2Q5VWT5 728 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 LVRNQ6Q4G3 990 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 NIPA1Q7RTP0 329 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF398Q8TD17 642 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 IFT43Q96FT9 208 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D22BQ9NU19 505 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 KANSL3Q9P2N6 904 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF148Q9UQR1 794 aa19.3■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 FZD9O00144 591 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 TLR3O15455 904 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 LIASO43766 372 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 WNT7BP56706 349 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 OCRLQ01968 901 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 RCN2Q14257 317 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 MAPK6Q16659 721 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 EXD1Q8NHP7 514 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 BTBD10Q9BSF8 475 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS37BQ9H9H4 285 aa19.29■□□□□ 0.68
RALGPS1-208ENST00000424082 SCOCQ9UIL1 159 aa19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms