RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413522.1

SNORD56-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56-201ENST00000413522 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 ITGALP20701 1170 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 NPTX2P47972 431 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 SLC11A2P49281 568 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 NDUFV1P49821 464 aa3.4□□□□□ -1.87
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SNORD56-201ENST00000413522 LAYNQ6UX15 382 aa3.4□□□□□ -1.87
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SNORD56-201ENST00000413522 AVPR1BP47901 424 aa3.39□□□□□ -1.87
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SNORD56-201ENST00000413522 TMEM108Q6UXF1 575 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 SUPT20HQ8NEM7 779 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 SSH3Q8TE77 659 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 APIPQ96GX9 242 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 Q96MF0 132 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 DPH1Q9BZG8 443 aa3.39□□□□□ -1.87
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SNORD56-201ENST00000413522 NUP62CLQ9H1M0 184 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.871e-34■■■□□ 14.6
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SNORD56-201ENST00000413522 TMEM233B4DJY2 109 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 APAF1O14727 1248 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 DCLK1O15075 740 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 CYP2C9P11712 490 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.874e-17■□□□□ 8.1
SNORD56-201ENST00000413522 TRIM27P14373 513 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 CD6P30203 668 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 ACVRL1P37023 503 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 VIPR2P41587 438 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF134P52741 427 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 LILRA4P59901 499 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 BLOC1S1P78537 153 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 PURAQ00577 322 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 TAP1Q03518 808 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 FSTL1Q12841 308 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD56-201ENST00000413522 KLF10Q13118 480 aa3.38□□□□□ -1.87
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