RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 CEP290O15078 2479 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 M0QZQ0 153 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ALDH2P05091 517 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 CDR1P51861 262 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 SUSD3Q96L08 255 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 SNX25Q9H3E2 840 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 PTPRSQ13332 1948 aa24.77■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.77■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ATP2C2O75185 946 aa24.77■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ARHGAP25P42331 645 aa24.77■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 BCAR1P56945 870 aa24.77■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 KIAA0319Q5VV43 1072 aa24.77■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ZNF677Q86XU0 584 aa24.77■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 TTC39CQ8N584 583 aa24.77■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.77■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 UNC93AQ86WB7 457 aa24.76■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 FAN1Q9Y2M0 1017 aa24.76■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 ZSCAN12O43309 604 aa24.76■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 TADA2AO75478 443 aa24.76■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 VAV2P52735 878 aa24.76■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 KIAA1328Q86T90 577 aa24.76■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.76■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 ODC1P11926 461 aa24.75■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa24.75■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.75■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.75■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.75■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.75■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 CYP11A1P05108 521 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 SMYD5Q6GMV2 418 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 O00370 1275 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 VDRP11473 427 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 TKTP29401 623 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 NAA35Q5VZE5 725 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 B3GALT6Q96L58 329 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 ISCUQ9H1K1 167 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 LAMA3Q16787 3333 aa24.74■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 GJB5O95377 273 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 FAM163BP0C2L3 166 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 GALCP54803 685 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 SGO2Q562F6 1265 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 HERVK_113Q902F9 699 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 YME1L1Q96TA2 773 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 COLEC11Q9BWP8 271 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 GZMAP12544 262 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 NOMO3P69849 1222 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 C2CD6Q53TS8 623 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 PCDHGC3Q9UN70 934 aa24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 MICAL2O94851 1124 aa24.72■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 CCDC130P13994 396 aa24.72■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 PAX3P23760 479 aa24.72■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 LHX1P48742 406 aa24.72■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 CNGA2Q16280 664 aa24.72■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 TAS1R1Q7RTX1 841 aa24.72■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa24.72■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.72■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 RTN2O75298 545 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 ABCB4P21439 1286 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 ACAD10Q6JQN1 1059 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 UBA3Q8TBC4 463 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 H2AFZP0C0S5 128 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.71■■□□□ 1.55
CNN3-202ENST00000394202 FUT10Q6P4F1 479 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms