RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 SETDB2Q96T68 719 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 NFASCO94856 1347 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 GOLGA8RI6L899 631 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 STRNO43815 780 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 NLRX1Q86UT6 975 aa22.85■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.84■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 PTP4A2Q12974 167 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 PYDC1Q8WXC3 89 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 YIPF2Q9BWQ6 316 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ANO3Q9BYT9 981 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 C1orf21Q9H246 121 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ITGB4P16144 1822 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 E5RJQ4 531 aa22.84■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 PRR16Q569H4 304 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ARPINQ7Z6K5 226 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 SLC35B4Q969S0 331 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 SLAIN2Q9P270 581 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 UBE4BO95155 1302 aa22.84■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 A0A088AWK7 358 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 TBX3O15119 743 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 P4HA2O15460 535 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 BMP3P12645 472 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 TMED1Q13445 227 aa22.83■■□□□ 1.25
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OPN3-201ENST00000366554 PARVGQ9HBI0 331 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 BTBD7Q9P203 1132 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 CLUHO75153 1309 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 GRIN3BO60391 1043 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 CYP11B1P15538 503 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ADRA2BP18089 450 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 BGNP21810 368 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 PEX2P28328 305 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ZNF543Q08ER8 600 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 MORF4L2Q15014 288 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 LENG9Q96B70 501 aa22.83■■□□□ 1.25
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB5O15062 677 aa22.82■■□□□ 1.24
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OPN3-201ENST00000366554 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SMYD1Q8NB12 490 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 ZFP28Q8NHY6 868 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 BTBD9Q96Q07 612 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 CNTN3Q9P232 1028 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 NDC80O14777 642 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 MAGEB3O15480 346 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 CLPTM1O96005 669 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 VARSP26640 1264 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 PDE1BQ01064 536 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 NADK2Q4G0N4 442 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 CENPUQ71F23 418 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 PAFAH2Q99487 392 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 STK24Q9Y6E0 443 aa22.82■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 OATP04181 439 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 CPOXP36551 454 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 GCLMP48507 274 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 NCOA4Q13772 614 aa22.81■■□□□ 1.24
OPN3-201ENST00000366554 GRIK5Q16478 980 aa22.81■■□□□ 1.24
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