RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361909.8

CMTM3-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-201ENST00000361909 ITGB5P18084 799 aa20.08■□□□□ 0.81
CMTM3-201ENST00000361909 POLE2P56282 527 aa20.08■□□□□ 0.81
CMTM3-201ENST00000361909 KCNA1Q09470 495 aa20.08■□□□□ 0.81
CMTM3-201ENST00000361909 UCMAQ8WVF2 138 aa20.08■□□□□ 0.81
CMTM3-201ENST00000361909 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.08■□□□□ 0.81
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CMTM3-201ENST00000361909 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.08■□□□□ 0.81
CMTM3-201ENST00000361909 RRAGCQ9HB90 399 aa20.08■□□□□ 0.81
CMTM3-201ENST00000361909 KCND2Q9NZV8 630 aa20.08■□□□□ 0.81
CMTM3-201ENST00000361909 FBXO40Q9UH90 709 aa20.08■□□□□ 0.81
CMTM3-201ENST00000361909 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.08■□□□□ 0.81
CMTM3-201ENST00000361909 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 PMM2O15305 246 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 DNAJC6O75061 913 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 PTP4A2Q12974 167 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 HHATQ5VTY9 493 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF365Q70YC5 407 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF653Q96CK0 615 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 HAUS5O94927 633 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 UPP2O95045 317 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 TRIM49P0CI25 452 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 TRIM49CP0CI26 452 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ARP10275 920 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 SLC1A1P43005 524 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 MAGEA4P43358 317 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 MYCT1Q8N699 235 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 FAM81BQ96LP2 452 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 MIPEPQ99797 713 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 GAS7O60861 476 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 SNAPC2Q13487 334 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 FAM91A1Q658Y4 838 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 IL31RAQ8NI17 732 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 CHST7Q9NS84 486 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 FETUBQ9UGM5 382 aa20.07■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 CAPN9O14815 690 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 KRT72Q14CN4 511 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 CCNG2Q16589 344 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 EPC2Q52LR7 807 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 FOXB2Q5VYV0 432 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 UIMC1Q96RL1 719 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.06■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 EML1O00423 815 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 GSC2O15499 205 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 MAFGO15525 162 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 CREB3O43889 395 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 OSBPP22059 807 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 CA4P22748 312 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 CYP2J2P51589 502 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 OLFM3Q96PB7 478 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 BTBD7Q9P203 1132 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 F8W8V4 182 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 TYROBPO43914 113 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 STAM2O75886 525 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 CCND2P30279 289 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 NSL1Q96IY1 281 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 IWS1Q96ST2 819 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM3-201ENST00000361909 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms