RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.28■■□□□ 1.32
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HOXA4-201ENST00000360046 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXA4-201ENST00000360046 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXA4-201ENST00000360046 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXA4-201ENST00000360046 NME7Q9Y5B8 376 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXA4-201ENST00000360046 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGEF37A1IGU5 675 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXA4-201ENST00000360046 M0QZQ0 153 aa23.28■■□□□ 1.32
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HOXA4-201ENST00000360046 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXA4-201ENST00000360046 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.27■■□□□ 1.32
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HOXA4-201ENST00000360046 DSEQ9UL01 958 aa23.27■■□□□ 1.32
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HOXA4-201ENST00000360046 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.26■■□□□ 1.31
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HOXA4-201ENST00000360046 SLC9A7Q96T83 725 aa23.26■■□□□ 1.31
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HOXA4-201ENST00000360046 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.26■■□□□ 1.31
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HOXA4-201ENST00000360046 TFR2Q9UP52 801 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 GABRDO14764 452 aa23.25■■□□□ 1.31
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HOXA4-201ENST00000360046 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.25■■□□□ 1.31
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HOXA4-201ENST00000360046 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.25■■□□□ 1.31
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HOXA4-201ENST00000360046 C12orf29Q8N999 325 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 TNIP3Q96KP6 325 aa23.25■■□□□ 1.31
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HOXA4-201ENST00000360046 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 PACSIN1Q9BY11 444 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.24■■□□□ 1.31
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HOXA4-201ENST00000360046 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 CEP83Q9Y592 693 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 RCCD1A6NED2 376 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 GZMAP12544 262 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 TYMPP19971 482 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 KIF5AQ12840 1032 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 SHHQ15465 462 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 NAA35Q5VZE5 725 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.23■■□□□ 1.31
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HOXA4-201ENST00000360046 SPATA18Q8TC71 538 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 INSL6Q9Y581 213 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 O00370 1275 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 TLL1O43897 1013 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 RTN2O75298 545 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 H2AFZP0C0S5 128 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 TKTP29401 623 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 FUT10Q6P4F1 479 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 H2AFVQ71UI9 128 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.22■■□□□ 1.31
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