RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 KRT4P19013 534 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ARFIP2P53365 341 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 TDRPQ86YL5 185 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 RDH13Q8NBN7 331 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 LMO3Q8TAP4 145 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 SKA1Q96BD8 255 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 HSD17B14Q9BPX1 270 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 NEU2Q9Y3R4 380 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 C2orf71A6NGG8 1288 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 SLC26A4O43511 780 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 BAG2O95816 211 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ITGA2BP08514 1039 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 GRIA2P42262 883 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 MAP7Q14244 749 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 NME8Q8N427 588 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 OGFOD1Q8N543 542 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 HEMGNQ9BXL5 484 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 OSBPL8Q9BZF1 889 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 EBF3Q9H4W6 596 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ARMCX1Q9P291 453 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ZNF510Q9Y2H8 683 aa17.69■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 PSMD10O75832 226 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 DESP17661 470 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CRABP2P29373 138 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP24Q8N264 748 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CCDC89Q8N998 374 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 EPS8L1Q8TE68 723 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 FAM151AQ8WW52 585 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 KAT5Q92993 513 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 PPP2R3CQ969Q6 453 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 VPS37BQ9H9H4 285 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 HSFX1Q9UBD0 423 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CNTNAP1P78357 1384 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CYP1A2P05177 515 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CDK16Q00536 496 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 P3H1Q32P28 736 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 BBOF1Q8ND07 529 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 MPP4Q96JB8 637 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 IWS1Q96ST2 819 aa17.68■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 HARSP12081 509 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 RFX1P22670 979 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 RAP1GDS1P52306 607 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 SLC15A2Q16348 729 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 LRRC6Q86X45 466 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ZNF577Q9BSK1 485 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ARHGEF4Q9NR80 690 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 OLFML3Q9NRN5 406 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 GTF3C4Q9UKN8 822 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 GMEB1Q9Y692 573 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 DNAJC6O75061 913 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 OR6B1O95007 311 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 DGKZQ13574 1117 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 DBN1Q16643 649 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CEP55Q53EZ4 464 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 SATL1Q86VE3 508 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 LDHDQ86WU2 507 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 FBXO27Q8NI29 283 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 AGBL1Q96MI9 1066 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 PHACTR1Q9C0D0 580 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 UNC45AQ9H3U1 944 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CLIC5Q9NZA1 410 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 PPM1HQ9ULR3 514 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CHMP2BQ9UQN3 213 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 F8W8V4 182 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 H3BRJ5 948 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 OLFML2BQ68BL8 750 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 C1orf186Q6ZWK4 172 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ACAD11Q709F0 780 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 ZNF276Q8N554 614 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CLPTM1LQ96KA5 538 aa17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 GZMAP12544 262 aa17.66■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 PRELPP51888 382 aa17.66■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 BFSP1Q12934 665 aa17.66■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 KRT72Q14CN4 511 aa17.66■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 RAPH1Q70E73 1250 aa17.66■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 CHURC1Q8WUH1 139 aa17.66■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 PANX3Q96QZ0 392 aa17.66■□□□□ 0.42
GDE1-201ENST00000353258 SH2D3AQ9BRG2 576 aa17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms