RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 THAP2Q9H0W7 228 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP3A43Q9HB55 503 aa17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 PSTPIP1O43586 416 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 TLR2O60603 784 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 POLBP06746 335 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNA2P16389 499 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRP35270 261 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 VGLL2Q8N8G2 317 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 TPCN2Q8NHX9 752 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMA6BQ9H3T3 888 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNQ5Q9NR82 932 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 FNTAP49354 379 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 DDIASQ8IXT1 998 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 E2F6O75461 281 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPA1O75762 1119 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 VTNP04004 478 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ATICP31939 592 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGEF7Q14155 803 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SGSM3Q96HU1 749 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SCOCQ9UIL1 159 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 RAD51CO43502 376 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 PPFIA2O75334 1257 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 PPATQ06203 517 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP24A1Q07973 514 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 PTK2BQ14289 1009 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 USP10Q14694 798 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 VTA1Q9NP79 307 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 DSEQ9UL01 958 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF20BQ96Q89 1820 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 MROH2AA6NES4 1674 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP11B1P15538 503 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 MFN1Q8IWA4 741 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSWIM1Q9BR11 485 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHGB4Q9UN71 923 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP99D6REC4 459 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ASMTLO95671 621 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 LRG1P02750 347 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 THP07101 528 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXC6P09630 235 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 RARRES1P49788 294 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf146Q5VVC0 180 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 MMGT1Q8N4V1 131 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 FOPNLQ96NB1 174 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A087WZ62 844 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 M0QYT0 321 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC11A2P49281 568 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 BCAT1P54687 386 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 TWF1Q12792 350 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SEPT8Q92599 483 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 CHMP2BQ9UQN3 213 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 GAKO14976 1311 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 AKAP3O75969 853 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 RPSAP08865 295 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 AKT1P31749 480 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 NRBF2Q96F24 287 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 CYB561D2O14569 222 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R37O75864 691 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 PYGLP06737 847 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 IRF1P10914 325 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 GCKP35557 465 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEA4P43358 317 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SYCP2LQ5T4T6 812 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ACOT1Q86TX2 421 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 WDCPQ9H6R7 721 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SMYD3Q9H7B4 428 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 CHUKO15111 745 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SGPL1O95470 568 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 INSRRP14616 1297 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 PTGER2P43116 358 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 RBBP7Q16576 425 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIL6Q8IXY8 311 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 SPIRE2Q8WWL2 714 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLPH3Q9H4A6 298 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 STOML1Q9UBI4 398 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ANXA9O76027 345 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 COILP38432 576 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC30BQ8N4P2 665 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 IPMKQ8NFU5 416 aa17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS1R2Q8TE23 839 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms