RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 NCOR2Q9Y618 2525 aa20.1■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 PRAMEF12O95522 483 aa20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 DMWDQ09019 674 aa20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 POSTNQ15063 836 aa20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 CSRP2Q16527 193 aa20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 LPAL2Q16609 132 aa20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 Q6ZS52 159 aa20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 KPNA7A9QM74 516 aa20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 SLC30A4O14863 429 aa20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.816e-7■□□□□ 8.8
PUS1-201ENST00000322060 GRIN1Q05586 938 aa20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 PON2Q15165 354 aa20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 TAF12Q16514 161 aa20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 WSCD1Q658N2 575 aa20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 STRA6Q9BX79 667 aa20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 SEMA4GQ9NTN9 838 aa20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PUS1-201ENST00000322060 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 DCDC2BA2VCK2 349 aa20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 PPP1R37O75864 691 aa20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 IL18RAPO95256 599 aa20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 PNPLA4P41247 253 aa20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 CYP4F8P98187 520 aa20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 TNK2Q07912 1038 aa20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 SV2CQ496J9 727 aa20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 GKN1Q9NS71 199 aa20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 TISP43B9A030 160 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 F11P03951 625 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 ADSSP30520 456 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 SCN1AP35498 2009 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 NLRP12P59046 1061 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 TTC8Q8TAM2 541 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 GIPC2Q8TF65 315 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 ZNF560Q96MR9 790 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 STK17AQ9UEE5 414 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 TSC2P49815 1807 aa20.06■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 ATG13O75143 517 aa20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 AMPD2Q01433 879 aa20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 RUNX3Q13761 415 aa20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 LOXL4Q96JB6 756 aa20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 TDP1Q9NUW8 608 aa20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 ANK1P16157 1881 aa20.05■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 CSH1P0DML2 217 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 CSH2P0DML3 217 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 AVPR1AP37288 418 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 TSPY1Q01534 308 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.81e-6■■■□□ 18.5
PUS1-201ENST00000322060 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 MON1AQ86VX9 555 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 SFR1Q86XK3 245 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 ACBD6Q9BR61 282 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 ABCB6Q9NP58 842 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.04■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 ADRB1P08588 477 aa20.03■□□□□ 0.8
PUS1-201ENST00000322060 GAP43P17677 238 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms