RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311160.13

TNS3-201, Transcript of tensin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS3, Length 7,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-201ENST00000311160 PODXLO00592 558 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 MYL2P10916 166 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 VAV1P15498 845 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 ALDH1A3P47895 512 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 BCAR1P56945 870 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 RBL2Q08999 1139 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 RBBP8Q99708 897 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 NUP85Q9BW27 656 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 TNKS2Q9H2K2 1166 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 SERPING1P05155 500 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 ATPAF2Q8N5M1 289 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 WDR11Q9BZH6 1224 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 EHD3Q9NZN3 535 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 VPS4BO75351 444 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 SEMA3DO95025 777 aa11.13□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 MGAT4DA6NG13 374 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 STX16O14662 325 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 SGSM2O43147 1006 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 RAD17O75943 681 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 MSL3P1P0C860 447 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 LSP1P33241 339 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 MYBPC1Q00872 1141 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 LINS1Q8NG48 757 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 CRELD1Q96HD1 420 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 DNAJC12Q9UKB3 198 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 KBTBD13C9JR72 458 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 MGRN1O60291 552 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 CHMLP26374 656 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 MTTPP55157 894 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 PTSQ03393 145 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 USP7Q93009 1102 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 MCUBQ9NWR8 336 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 PCDH8O95206 1070 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 CYP2C19P33261 490 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 ARMCX6Q7L4S7 300 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 RCOR2Q8IZ40 523 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 MED8Q96G25 268 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 WDR41Q9HAD4 459 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 ZNF222Q9UK12 451 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 EFR3AQ14156 821 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 ZNF846Q147U1 533 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 CNKSR1Q969H4 720 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 KIF12Q96FN5 646 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 CLEC4AQ9UMR7 237 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 PDE5AO76074 875 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 DBIP07108 87 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 NCK1P16333 377 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 ATG16L2Q8NAA4 619 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 DBNDD2Q9BQY9 259 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 TTC34A8MYJ7 566 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 SSNA1O43805 119 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 LRG1P02750 347 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 CDH6P55285 790 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 NME5P56597 212 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 VAC14Q08AM6 782 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 CHAMP1Q96JM3 812 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 HMGXB3Q12766 1538 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 APRTP07741 180 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 ALOX12P18054 663 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 CASP4P49662 377 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 ACAP2Q15057 778 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 C12orf60Q5U649 245 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 GPRASP2Q96D09 838 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 TBATAQ96M53 351 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 ASNA1O43681 348 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 MFAP3LO75121 409 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 STARD3Q14849 445 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa11.11□□□□□ -0.63
TNS3-201ENST00000311160 LONP2Q86WA8 852 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms