RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 ZBTB39O15060 712 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 NPTX2P47972 431 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 TNFAIP2Q03169 654 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 MAPK6Q16659 721 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF394Q53GI3 561 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF667Q5HYK9 610 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 BTBD8Q5XKL5 378 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC34Q8IZ02 419 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 GPRASP2Q96D09 838 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 GLT1D1Q96MS3 346 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 NUDCD1Q96RS6 583 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 GINM1Q9NU53 330 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 FSBPO95073 299 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 CPB1P15086 417 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 GARTP22102 1010 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 ARL4DP49703 201 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 ARSEP51690 589 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 FBXW4P57775 412 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM259Q4ZIN3 620 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 HDDC2Q7Z4H3 204 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGEF19Q8IW93 802 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 SEMA4AQ9H3S1 761 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 SMYD2Q9NRG4 433 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 SUN2Q9UH99 717 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 SNAPC2Q13487 334 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF699Q32M78 642 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC57Q8N9N7 239 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 DNAAF3Q8N9W5 541 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 C9orf72Q96LT7 481 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC37BQ96QE4 947 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 MMP19Q99542 508 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 WDR18Q9BV38 432 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM15Q9C019 465 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 ZWILCHQ9H900 591 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 CYBBP04839 570 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 SDE2Q6IQ49 451 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 SLC47A2Q86VL8 602 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 ATP11CQ8NB49 1132 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 OR6B3Q8NGW1 331 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 BTBD6Q96KE9 485 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC4BQ9NT99 713 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-201ENST00000295874 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 ACOT2P49753 483 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 HDAC4P56524 1084 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 OSTNP61366 133 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 ST8SIA6P61647 398 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 MTMR2Q13614 643 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 P3H1Q32P28 736 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 TAS1R2Q8TE23 839 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 MYH8P13535 1937 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 UBR2Q8IWV8 1755 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 PSTPIP1O43586 416 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 EFNA5P52803 228 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 TFDP2Q14188 446 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 C16orf87Q6PH81 154 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 ZBED8Q8IZ13 594 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R16BQ96T49 567 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 TSC22D3Q99576 134 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 ZBTB18Q99592 522 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 PI4K2AQ9BTU6 479 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 ING2Q9H160 280 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 AAASQ9NRG9 546 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 RALAP11233 206 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 RPL21P46778 160 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 PRKCEQ02156 737 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC15Q0P6D6 951 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 DUOXA2Q1HG44 320 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 PPP4R4Q6NUP7 873 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 CEP70Q8NHQ1 597 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 FAM47DPA6NHR8 397 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 DAB1O75553 588 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 MCF2P10911 925 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 PMLP29590 882 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 GRAMD1BQ3KR37 738 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-201ENST00000295874 EPC2Q52LR7 807 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms