RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 TAF12Q16514 161 aa20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 FLCNQ8NFG4 579 aa20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 SMARCD2Q92925 531 aa20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 RMND1Q9NWS8 449 aa20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.31■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 PTPRJQ12913 1337 aa20.3■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 STK25O00506 426 aa20.3■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 PHACTR2O75167 634 aa20.3■□□□□ 0.84
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MALSU1-201ENST00000287543 CCR2P41597 374 aa20.3■□□□□ 0.84
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MALSU1-201ENST00000287543 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.3■□□□□ 0.84
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MALSU1-201ENST00000287543 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.3■□□□□ 0.84
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MALSU1-201ENST00000287543 TECTAO75443 2155 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TRIP11Q15643 1979 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 MAPK13O15264 365 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 PRR29P0C7W0 189 aa20.29■□□□□ 0.84
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MALSU1-201ENST00000287543 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 CDC25CP30307 473 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 CLDN10P78369 228 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TMC8Q8IU68 726 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TMC2Q8TDI7 906 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 GCNAQ96QF7 691 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 MMS19Q96T76 1030 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 KXD1Q9BQD3 176 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 CA14Q9ULX7 337 aa20.29■□□□□ 0.84
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MALSU1-201ENST00000287543 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TNNC1P63316 161 aa20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 PRKCQQ04759 706 aa20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TEAD2Q15562 447 aa20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 IER5LQ5T953 404 aa20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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MALSU1-201ENST00000287543 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 FAM84AQ96KN4 292 aa20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TIGD1Q96MW7 591 aa20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.28■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.28■□□□□ 0.84
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MALSU1-201ENST00000287543 KRBA1A5PL33 1030 aa20.27■□□□□ 0.84
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MALSU1-201ENST00000287543 CSH2P0DML3 217 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 ENPEPQ07075 957 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 BIRC3Q13489 604 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 CEP135Q66GS9 1140 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM105Q8N8V8 129 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF516Q92618 1163 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 GSDMAQ96QA5 445 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 SNX25Q9H3E2 840 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.27■□□□□ 0.84
MALSU1-201ENST00000287543 SOBPA7XYQ1 873 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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