RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273179.9

CTDSPL-201, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSPL, Length 4,459 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-201ENST00000273179 GSSP48637 474 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 GNG2P59768 71 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SPIDRQ14159 915 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SSX2Q16385 188 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 FSIP1Q8NA03 581 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SCFD2Q8WU76 684 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 KLHL29Q96CT2 875 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 TINF2Q9BSI4 451 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 BTBD2Q9BX70 525 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 LGR6Q9HBX8 967 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 ABCB6Q9NP58 842 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 NDE1Q9NXR1 346 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 J3KRW8 73 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 BTN3A1O00481 513 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 MX1P20591 662 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 IL1RL1Q01638 556 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 AGAP11Q8TF27 550 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 CEP170P1Q96L14 293 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 KRT84Q9NSB2 600 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SETD4Q9NVD3 440 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 B8ZZF3 427 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 CCNKO75909 580 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 PDCP20941 246 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 STARP49675 285 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 ATP8B2P98198 1209 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 PDCLQ13371 301 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 FAM189A2Q15884 450 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 TAMM41Q96BW9 452 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 CITED4Q96RK1 184 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 APPL1Q9UKG1 709 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 USP32Q8NFA0 1604 aa9.3□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 H3BQV1 296 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SNAP29O95721 258 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 PRKCEQ02156 737 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 STARD3Q14849 445 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 CLCA4Q14CN2 919 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 FCRLBQ6BAA4 426 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 TMC7Q7Z402 723 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 CAMK1DQ8IU85 385 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 NELFBQ8WX92 580 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 MCUR1Q96AQ8 359 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 34.7
CTDSPL-201ENST00000273179 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 REREQ9P2R6 1566 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 VAV1P15498 845 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SOX6P35712 828 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 RGS7P49802 495 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 CPT1AP50416 773 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 FAM209BQ5JX69 171 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 ITPKCQ96DU7 683 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 WDR24Q96S15 920 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 FNIP2Q9P278 1114 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 TMEM120BA0PK00 339 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 HGSO14964 777 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 KCNN4O15554 427 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 NDUFV2P19404 249 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 ABCG1P45844 678 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 HPCAP84074 193 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 UBE3AQ05086 875 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 MAP3K12Q12852 859 aa9.29□□□□□ -0.92
CTDSPL-201ENST00000273179 MAP2K5Q13163 448 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms