RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PORCNQ9H237 461 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1257Q9ULG3 409 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 E7ENQ6 273 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CCDC22O60826 627 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 UBOX5O94941 541 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CCT6BQ92526 530 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GYG2O15488 501 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ATICP31939 592 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CCNA1P78396 465 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 RIPK1Q13546 671 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PIGWQ7Z7B1 504 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 DAW1Q8N136 415 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SEMA4DQ92854 862 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 KLHL11Q9NVR0 708 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 AKT3Q9Y243 479 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SDC4P31431 198 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TBCCQ15814 346 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 QPCTQ16769 361 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TTC27Q6P3X3 843 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 RNF149Q8NC42 400 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 IL31RAQ8NI17 732 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 LIASO43766 372 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SLURP2P0DP57 97 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ECHS1P30084 290 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 C6orf89Q6UWU4 347 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MICALL2Q8IY33 904 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ALLCQ8N6M5 410 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZNF606Q8WXB4 792 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ERP27Q96DN0 273 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 NLRP4Q96MN2 994 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SLITRK1Q96PX8 696 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 STRA6Q9BX79 667 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GPR88Q9GZN0 384 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JND7 137 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MAP3K7O43318 606 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CST8O60676 142 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A27O95847 323 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GSTA2P09210 222 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 GPD1P21695 349 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 CDH6P55285 790 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 BCAR1P56945 870 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 NOMO3P69849 1222 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TTLL4Q14679 1199 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PDK2Q15119 407 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 UGCGQ16739 394 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PALB2Q86YC2 1186 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ZNF398Q8TD17 642 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TTC17Q96AE7 1141 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 WDR91A4D1P6 747 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TOMM70O94826 608 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ITGAVP06756 1048 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 TGFB3P10600 412 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 ALADP13716 330 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 RBP5P82980 135 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 LONP2Q86WA8 852 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 LMO3Q8TAP4 145 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 INPP5DQ92835 1189 aa9.28□□□□□ -0.92
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms