RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 139.3
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CSDE1-201ENST00000261443 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.58□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 MAST2Q6P0Q8 1798 aa7.58□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 EMSYQ7Z589 1322 aa7.58□□□□□ -1.2
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CSDE1-201ENST00000261443 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 BANF1O75531 89 aa7.57□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 BMP3P12645 472 aa7.57□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF24P17028 368 aa7.57□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 POLD1P28340 1107 aa7.57□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 ARSEP51690 589 aa7.57□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 DLG4P78352 724 aa7.57□□□□□ -1.2
CSDE1-201ENST00000261443 IRX4P78413 519 aa7.57□□□□□ -1.2
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