RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 DPH6Q7L8W6 267 aa22.55■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 GPR149Q86SP6 731 aa22.55■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.55■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.55■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.55■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.55■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 STX10O60499 249 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 CLSTN1O94985 981 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 ADCY1Q08828 1119 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 CCDC142Q17RM4 750 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 SPATA18Q8TC71 538 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 SEMA4DQ92854 862 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 DACH1Q9UI36 760 aa22.54■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 MTMR11A4FU01 709 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 RAP1GAPP47736 663 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 CES5AQ6NT32 575 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 PKMYT1Q99640 499 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 SDCBP2Q9H190 292 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 POMKQ9H5K3 350 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 NOTCH4Q99466 2003 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 PTPRDP23468 1912 aa22.53■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 TACC1O75410 805 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 GNA14O95837 355 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 LMO2P25791 158 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 LHX1P48742 406 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 MYL7Q01449 175 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 TAF4BQ92750 862 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 ACBD6Q9BR61 282 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.52■■□□□ 1.2
COX5B-201ENST00000258424 PRRG1O14668 218 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 CCL16O15467 120 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 HOXA9P31269 272 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 ELF1P32519 619 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 MTHFRP42898 656 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 ASPAP45381 313 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 FMO5P49326 533 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 CDH8P55286 799 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 STX1AQ16623 288 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 UVSSAQ2YD98 709 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.51■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 ATP2C2O75185 946 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 PDGFRBP09619 1106 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 CCDC192P0DO97 292 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 ZXDAP98168 799 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 TSPY1Q01534 308 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 DUSP4Q13115 394 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 SYT15Q9BQS2 421 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 RAB20Q9NX57 234 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 MAFFQ9ULX9 164 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 YIPF1Q9Y548 306 aa22.5■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 FAM163BP0C2L3 166 aa22.49■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 PCSK1P29120 753 aa22.49■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
COX5B-201ENST00000258424 TYRO3Q06418 890 aa22.49■■□□□ 1.19
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