RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257604.9

TRAFD1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene TRAFD1, Length 3,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-201ENST00000257604 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SNX9Q9Y5X1 595 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 M0QYV0 167 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PHF2O75151 1096 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PIAS1O75925 651 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GTF2A2P52657 109 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ACVR2BQ13705 512 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 HSPH1Q92598 858 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 LRRC45Q96CN5 670 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PARP2Q9UGN5 583 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TBK1Q9UHD2 729 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 A6NNZ2 444 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ECEL1O95672 775 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ETS1P14921 441 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TNFAIP2Q03169 654 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CUL1Q13616 776 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TUBB8Q3ZCM7 444 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RAPGEF5Q92565 580 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 STYXL1Q9Y6J8 313 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 HTTP42858 3142 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PPEF2O14830 753 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CTSHP09668 335 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 YARSP54577 528 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ATP11AP98196 1134 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC29A2Q14542 456 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 HPDLQ96IR7 371 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ADPGKQ9BRR6 497 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TINF2Q9BSI4 451 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PLVAPQ9BX97 442 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MIS12Q9H081 205 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PSMA2P25787 234 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF365Q70YC5 407 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MON1BQ7L1V2 547 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MREGQ8N565 214 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 COX16Q9P0S2 106 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 H0YGN5 161 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MCL1Q07820 350 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CD302Q8IX05 232 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 FEZF2Q8TBJ5 459 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MAML3Q96JK9 1138 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CALN1Q9BXU9 219 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SDCBP2Q9H190 292 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 NFS1Q9Y697 457 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.074e-6■■□□□ 12
TRAFD1-201ENST00000257604 MTHFD1LQ6UB35 978 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ACAP3Q96P50 834 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 FAM114A2Q9NRY5 505 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SIX4Q9UIU6 781 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CHUKO15111 745 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 NRLP54845 237 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 OGDHQ02218 1023 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 CENPCQ03188 943 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 TMEM132DQ14C87 1099 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 C6orf89Q6UWU4 347 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 TMC3Q7Z5M5 1100 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 OSBPL8Q9BZF1 889 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 PARVAQ9NVD7 372 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa15.46■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 LGR5O75473 907 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 RASSF9O75901 435 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 UPP2O95045 317 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 CHRNA3P32297 505 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF792Q3KQV3 632 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 RAB6CQ53S08 254 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 DENND2CQ68D51 928 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms