RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 TSC2P49815 1807 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 NCANO14594 1321 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CCNE1P24864 410 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CASP5P51878 434 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 TSPY1Q01534 308 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 STK38Q15208 465 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 EXTL3O43909 919 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 HUS1O60921 280 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 ITGB3P05106 788 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 ATF6P18850 670 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 NRLP54845 237 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 TSSK4Q6SA08 328 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 PDILTQ8N807 584 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 GIPC2Q8TF65 315 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 BACH2Q9BYV9 841 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 A0A087X0B3 334 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 LILRB5O75023 590 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CHRNB1P11230 501 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CCR3P51677 355 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CDR1P51861 262 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 ACBD6Q9BR61 282 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 TNMDQ9H2S6 317 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 IL21Q9HBE4 155 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 COL4A2P08572 1712 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 SPTLC2O15270 562 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 WNT7BP56706 349 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 RBP5P82980 135 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CYP4F8P98187 520 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 PLCB2Q00722 1185 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 MYL7Q01449 175 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC32Q14392 662 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 GPD1LQ8N335 351 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 DCLK2Q8N568 766 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF292O60281 2723 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 PPP6R2O75170 966 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 KRT19P08727 400 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 AMPD3Q01432 767 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 BFSP1Q12934 665 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 SPATA18Q8TC71 538 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 EPC1Q9H2F5 836 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 CUEDC2Q9H467 287 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 NCDNQ9UBB6 729 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 L1RE1Q9UN81 338 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-201ENST00000250495 SOBPA7XYQ1 873 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 CSH1P0DML2 217 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 CSH2P0DML3 217 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-201ENST00000250495 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.211e-6■■■□□ 15.5
NEDD8-201ENST00000250495 CXCL12P48061 93 aa22.64■■□□□ 1.21
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