RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 ELF1P32519 619 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 LHX1P48742 406 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 DUSP4Q13115 394 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 CBWD6Q4V339 395 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 CBWD3Q5JTY5 395 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 CBWD5Q5RIA9 395 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 KRT39Q6A163 491 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 MMS19Q96T76 1030 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 SDCBP2Q9H190 292 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 INSL5Q9Y5Q6 135 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 MBD3O95983 291 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 CDH8P55286 799 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 ZNF699Q32M78 642 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 PRRG1O14668 218 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 ATP2C2O75185 946 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 MARSP56192 900 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 NTHL1P78549 312 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 FAM171BQ6P995 826 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 GJD3Q8N144 294 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 TAF4BQ92750 862 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 CEP72Q9P209 647 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 COQ4Q9Y3A0 265 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 DOCK8Q8NF50 2099 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 PIK3CAP42336 1068 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 TNNC1P63316 161 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 MYL7Q01449 175 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 TRIM59Q8IWR1 403 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 YIPF1Q9Y548 306 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 C2CD4DB7Z1M9 353 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 SOAT2O75908 522 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 PDGFRBP09619 1106 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 ASPAP45381 313 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 RAP1GAPP47736 663 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 MXI1P50539 228 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 TWF1Q12792 350 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 SMARCB1Q12824 385 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.412e-6■■■■□ 20
SYF2-201ENST00000236273 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 PIDD1Q9HB75 910 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 CDH9Q9ULB4 789 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 CLUHO75153 1309 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 STX10O60499 249 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 XYLBO75191 536 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 SP100P23497 879 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 PCSK1P29120 753 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 TSPY1Q01534 308 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 POTEHQ6S545 545 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 SYT15Q9BQS2 421 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 BCO2Q9BYV7 579 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 RAB20Q9NX57 234 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 USTQ9Y2C2 406 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-201ENST00000236273 DLL1O00548 723 aa23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PMM2O15305 246 aa23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 GNA14O95837 355 aa23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 LRG1P02750 347 aa23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 OR6B3Q8NGW1 331 aa23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 LRRC3Q9BY71 257 aa23.83■■□□□ 1.4
SYF2-201ENST00000236273 MYO10Q9HD67 2058 aa23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms