RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 PYGMP11217 842 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TAS2R40P59535 323 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TNNC1P63316 161 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SERINC5Q86VE9 423 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.99□□□□□ -1.29
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CNIH1-201ENST00000216416 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.99□□□□□ -1.29
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CNIH1-201ENST00000216416 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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CNIH1-201ENST00000216416 CKBP12277 381 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CEP57Q86XR8 500 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 RFFLQ8WZ73 363 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 DPH5Q9H2P9 285 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ZWILCHQ9H900 591 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 E5RJQ4 531 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PJA2O43164 708 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SOAT2O75908 522 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 LCP1P13796 627 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CACNA2D1P54289 1103 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PMF1Q6P1K2 205 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 F5H423 210 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 P4HA2O15460 535 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 GLI1P08151 1106 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 LILRA4P59901 499 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF410Q86VK4 478 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 OSTM1Q86WC4 334 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SNX27Q96L92 541 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ISCUQ9H1K1 167 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 RTN2O75298 545 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 GABBR2O75899 941 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PAK2Q13177 524 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TTC30AQ86WT1 665 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.297e-7■■■□□ 15.6
CNIH1-201ENST00000216416 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ABCB6Q9NP58 842 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 KPNA7A9QM74 516 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 C2CD2LO14523 706 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 DYNC1I1O14576 645 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CD48P09326 243 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 GRM5P41594 1212 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TAF4BQ92750 862 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PWWP2AQ96N64 755 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 AMFRQ9UKV5 643 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 NENFQ9UMX5 172 aa6.98□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 MYO1FO00160 1098 aa6.97□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 MAPK13O15264 365 aa6.97□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PIAS1O75925 651 aa6.97□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SASH3O75995 380 aa6.97□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 MICAL2O94851 1124 aa6.97□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ERBB2P04626 1255 aa6.97□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM253P0C7T8 217 aa6.97□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ACRP10323 421 aa6.97□□□□□ -1.29
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