RNA–Protein interactions for RNA: YML034W

SRC1, Transcript of Inner nuclear membrane protein, yeast

Gene SRC1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRC1	YML034W	IES4	Q08561	116 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	GEP5	Q12393	293 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	ODC2	Q99297	307 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	VAR1	P02381	398 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	YGL010W	P25338	174 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	POP8	P38208	133 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	TRR2	P38816	342 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	YER085C	P40058	173 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	YJL028W	P47062	111 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	YJR015W	P47090	510 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	TTI2	P47168	421 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	LST7	P53237	242 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	PAU12	P53343	120 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	LOA1	Q06508	300 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	FRE8	Q12209	686 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	IZH2	Q12442	317 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRC1	YML034W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	CDC21	P06785	304 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YCR023C	P25351	611 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YCR007C	P25354	239 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	PAU2	P32612	120 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	MCH2	P36032	473 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	MBB1	P39534	108 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	PRM5	P40476	318 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YFL065C	P43539	102 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YIP3	P53633	176 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	GTO3	Q04806	366 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	NAT3	Q06504	195 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	CDD1	Q06549	142 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YPR203W	Q08994	102 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	STT4	P37297	1900 aa		2.59	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
SRC1	YML034W	MKK1	P32490	508 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	PMU1	P36069	295 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YEA6	P39953	335 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	DLS1	P40366	167 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YPS6	P40583	537 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	PDR17	P53844	350 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YNL140C	P53910	189 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YDL009C	Q12210	107 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	WSC4	P38739	605 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	DOG2	P38773	246 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	OXA1	P39952	402 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	PHS1	P40857	217 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	TAZ1	Q06510	381 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	PAM18	Q07914	168 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	MCT1	Q12283	360 aa		2.58	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YKR104W	P0CE69	306 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	PCL1	P24867	279 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	PPA2	P28239	310 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	OCH1	P31755	480 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	CSE2	P33308	149 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	TEM1	P38987	245 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	RPR2	P40571	144 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	EMC4	P53073	190 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	SLG1	P54867	378 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	FSH2	Q05015	223 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YPR114W	Q06107	315 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YOR385W	Q08909	290 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	STE7	P06784	515 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	DAL82	P21705	255 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	SPO13	P23624	291 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YCR100C	P25606	316 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YCR022C	P25620	114 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	CMC1	P36064	111 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YKL071W	P36086	256 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	ERG28	P40030	148 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	MTM1	P53320	366 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	AYT1	Q12226	474 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	ATO3	Q12359	275 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.57	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	GAL7	P08431	366 aa		2.56	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	FCY2	P17064	533 aa		2.56	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SRC1	YML034W	TKL2	P33315	681 aa		2.56	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.8 ms