RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	CORO7	P57737	925 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	HACD3	Q9P035	362 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PSMD3	O43242	534 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CSPG5	O95196	566 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	BMP6	P22004	513 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ACADSB	P45954	432 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5	5e-20	■■■■■ 44.9
AKAP9-216	ENST00000619023	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	RNF135	Q8IUD6	432 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRC43	Q8N309	656 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	AGR3	Q8TD06	166 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ELF1	P32519	619 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TTC36	A6NLP5	189 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PJA2	O43164	708 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SPAG6	O75602	509 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PGM1	P36871	562 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	BACE1	P56817	501 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ORC1	Q13415	861 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	C2CD6	Q53TS8	623 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	C3orf20	Q8ND61	904 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	INTS13	Q9NVM9	706 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	NDE1	Q9NXR1	346 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GZMA	P12544	262 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SOX10	P56693	466 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GDF3	Q9NR23	364 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CAND2	O75155	1236 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	APOE	P02649	317 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ESRRG	P62508	458 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MYBPC2	Q14324	1141 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GRIK5	Q16478	980 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	KCNK18	Q7Z418	384 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5	3e-6	■□□□□ 11.2
AKAP9-216	ENST00000619023	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	AP3B1	O00203	1094 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MIIP	Q5JXC2	388 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	STX3	Q13277	289 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ITIH4	Q14624	930 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.91	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	DGKD	Q16760	1214 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ZBTB18	Q99592	522 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ADA2	Q9NZK5	511 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	KLRC4	O43908	158 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SASH3	O75995	380 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	KDSR	Q06136	332 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	USP33	Q8TEY7	942 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	SUN2	Q9UH99	717 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MCF2	P10911	925 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	HSD17B4	P51659	736 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	DEUP1	Q05D60	604 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	HIC1	Q14526	733 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	WDR49	Q8IV35	697 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	BNIP3L	O60238	219 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	PRAME	P78395	509 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	C4orf22	Q6V702	233 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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