RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.86■□□□□ 0.93
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SGMS1-208ENST00000608287 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.86■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.86■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.86■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 CITO14578 2027 aa20.86■□□□□ 0.93
SGMS1-208ENST00000608287 SPAG17Q6Q759 2223 aa20.86■□□□□ 0.93
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SGMS1-208ENST00000608287 TM4SF5O14894 197 aa20.85■□□□□ 0.93
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SGMS1-208ENST00000608287 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SGMS1-208ENST00000608287 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
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SGMS1-208ENST00000608287 STRA6Q9BX79 667 aa20.81■□□□□ 0.92
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM9Q9C026 710 aa20.81■□□□□ 0.92
SGMS1-208ENST00000608287 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.81■□□□□ 0.92
SGMS1-208ENST00000608287 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.81■□□□□ 0.92
SGMS1-208ENST00000608287 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.81■□□□□ 0.92
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