RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600000.1

TIMM44-211, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM44, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-211ENST00000600000 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.18■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 VPS13AQ96RL7 3174 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 KPNA7A9QM74 516 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 EXTL3O43909 919 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 GARTP22102 1010 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 CASP1P29466 404 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 AMPD3Q01432 767 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 E2F4Q16254 413 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 CENPPQ6IPU0 288 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 TRIM9Q9C026 710 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 BRD9Q9H8M2 597 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 CYP11A1P05108 521 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 PAX3P23760 479 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 FCARP24071 287 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 VIPR2P41587 438 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 TAF12Q16514 161 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 GPD1LQ8N335 351 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 LEMD2Q8NC56 503 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 ASB16Q96NS5 453 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 CUEDC2Q9H467 287 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 COL4A2P08572 1712 aa20.16■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 USP34Q70CQ2 3546 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 MOSPD3O75425 235 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 GDI1P31150 447 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 PNPLA4P41247 253 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 AFMP43652 599 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 PRKCQQ04759 706 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 VEPH1Q14D04 833 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 GIPC2Q8TF65 315 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 SMARCD2Q92925 531 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.15■□□□□ 0.82
TIMM44-211ENST00000600000 HUS1O60921 280 aa20.14■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 STARD6P59095 220 aa20.14■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 TSPY1Q01534 308 aa20.14■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 VITQ6UXI7 678 aa20.14■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 ITIH5Q86UX2 942 aa20.14■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 TMC8Q8IU68 726 aa20.14■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 YAF2Q8IY57 180 aa20.14■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.14■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 FAM170BA6NMN3 283 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 MICAL2O94851 1124 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 TNNC2P02585 160 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 GABRR2P28476 465 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 CYP2J2P51589 502 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 EPHA5P54756 1037 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 CYP4F8P98187 520 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 GPR158Q5T848 1215 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 RDH13Q8NBN7 331 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 STKLD1Q8NE28 680 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 GCNAQ96QF7 691 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 BCO2Q9BYV7 579 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TIMM44-211ENST00000600000 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms