RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 PATJQ8NI35 1801 aa25.13■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 PRR23AA6NEV1 266 aa25.12■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 EXTL3O43909 919 aa25.12■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 GLULP15104 373 aa25.12■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 TEAD2Q15562 447 aa25.12■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.12■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.12■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 TTC9BQ8N6N2 239 aa25.12■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 KPNA7A9QM74 516 aa25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 GJA1P17302 382 aa25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 SLC39A12Q504Y0 691 aa25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 WSCD1Q658N2 575 aa25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 SHC4Q6S5L8 630 aa25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 ASCL5Q7RTU5 278 aa25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 IQUBQ8NA54 791 aa25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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MBD3-211ENST00000592965 PSMG2Q969U7 264 aa25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 LTB4R2Q9NPC1 389 aa25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa25.11■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 AMPD3Q01432 767 aa25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 SMARCB1Q12824 385 aa25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 TPRG1Q6ZUI0 275 aa25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 ITIH5Q86UX2 942 aa25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 C1orf127Q8N9H9 656 aa25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 DHX58Q96C10 678 aa25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 BRD9Q9H8M2 597 aa25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 MAGEF1Q9HAY2 307 aa25.1■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 A0A1W2PRU2 124 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 LRRN2O75325 713 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 FGF19O95750 216 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 F13A1P00488 732 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 PSMC3P17980 439 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 MAGEA9P43362 315 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 TUFMP49411 452 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 GRM2Q14416 872 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 UBXN2BQ14CS0 331 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 VITQ6UXI7 678 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 C1orf210Q8IVY1 113 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 GPD1LQ8N335 351 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.09■■□□□ 1.61
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MBD3-211ENST00000592965 CXorf38Q8TB03 319 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 TRPV5Q9NQA5 729 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 ITGA11Q9UKX5 1188 aa25.09■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 SOAT2O75908 522 aa25.08■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 ITGB3P05106 788 aa25.08■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 VIPR2P41587 438 aa25.08■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 ASIC1P78348 528 aa25.08■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 SPPL2BQ8TCT7 592 aa25.08■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 IRF7Q92985 503 aa25.08■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 HPS3Q969F9 1004 aa25.08■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 E2F7Q96AV8 911 aa25.08■■□□□ 1.61
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MBD3-211ENST00000592965 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.08■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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MBD3-211ENST00000592965 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.08■■□□□ 1.61
MBD3-211ENST00000592965 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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MBD3-211ENST00000592965 ATF6P18850 670 aa25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 HOXD13P35453 343 aa25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 VEPH1Q14D04 833 aa25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 ATL3Q6DD88 541 aa25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 ZNF852Q6ZMS4 543 aa25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 GAREM2Q75VX8 874 aa25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 LRRTM3Q86VH5 581 aa25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 C7orf25Q9BPX7 421 aa25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 NCANO14594 1321 aa25.07■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa25.06■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 SHISA7A6NL88 538 aa25.06■■□□□ 1.6
MBD3-211ENST00000592965 CD72P21854 359 aa25.06■■□□□ 1.6
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